Inflammasjon og luftveislidelser: Molekylær-biologisk karakterisering av gen-polymorfier assosiert med lungekreftrisiko (0971)

Bakgrunn:
Studien av normal genetisk variasjon er viktig for å forstå genetisk-betinget susceptibilitet for sykdom. Den normale variasjonen kan være bakgrunnen for et komplisert sykdomsbilde hvor multiple alleler i befolkningen kan bidra til kreftsusceptibilitet. Sekvensering av det humane genom har avdekket en stor grad av enkelnukleotid variasjoner (SNPer) i DNA molekylet (Sachidanandam R et al. 2001). Det er identifisert omlag 10x106 SNPer som utgjør 90% av alle genetiske variasjoner (Pastinen T et al. 2006). SNPer i regulatoriske (rSNPs) områder er av spesiell interesse da disse fines i promoter områder, enhancere eller ikke-kodende regioner som regulerer genuttrykk, RNA spleising, mRNA stabilitet og translasjonseffektivitet (Wang X et al. 2005). Analyse av rSNPs er derfor et viktig verktøy for å forstå hvordan SNPs påvirker regulering av signalveier i kreftutviklingsprosessen. En lang rekke av SNPer er funnet assosiert med susceptibilitet for lungekreft (Liu G et al, 2005). Det er nå stort behov for molekylærbiologisk karakterisering av risiko SNPs. Det er for tiden stor internasjonal aktivitet rundt kartlegging og funksjonell analyse av rSNPs (Sinnett D et al. 2006). 

Problemstilling:
Integrering av genotype data generert i molekylær-epidemiologiske analyser med funksjonelle studier av risikogenotyper er viktig. Gjennom våre pågående assosiasjonsstudier har vi identifisert en rekke SNPer som modulerer lungekreftrisikoen. I nåværende prosjektet vil vi fokusere på molekylær-biologiske studier som kan belyse mekanismer for den genotype-assosierte risikoen. Vi vil spesifikt undersøke om risikogenotyper i sentrale inflammasjonsgener (IL1B, COX-2) og gener i p53 signalveien (MDM-2) kan ha betydning for genuttrykk, DNA-protein binding, protein-protein binding, mRNA stabilitet og translasjonseffektivitet.

Skriv ut

Tips en venn